2018年から2020年に放送されていたアニメ「ゲゲゲの鬼太郎」第6期の映画化作品にあたる。「鬼太郎誕生 ゲゲゲの謎」のタイトルで、鬼太郎の誕生に隠された謎が描かれる。

因为负责管理时空之神的失误，导致平凡的上班女郎长濑香失去肉体，被迫移转到异世界继续生存下去。迫於无奈只能照办的香，告别了亲爱的家人与好友，与神谈好条件，来到异世界展开新的人生。仰赖著异世界女神所赋予的外挂能力以及道具箱，…

相田爱在老师的信赖下，成为了大贝第一中学学生会会长。在一次社会科的户外活动，她和同学来到地标建筑四叶塔（Clover Tower）参观，一路上忙着照顾众人。就在她终于可以停下来，期待展望台的景色时，巨大的怪物“自我中”突然出现，引起…